2010年大连医科大学在机构改革中，决定设立大连医科大学杂志社。大连医科大学杂志社的设立，是大连医科大学机构改革的最新创举，为所属杂志的信息交流、资源共享和协调发展提供了便利条件，也为杂志铺设了促向更高水平发展的快速通道，亦对大连医科大学主办、承办的杂志进行统一的归口管理。2010年10月26日，校党委常委会任命了杂志社的领导，并在2010年11月25日宣布了杂志社正式成立。
大连医科大学杂志社现有三本专业性学术期刊：《大连医科大学学报》《医学与哲学》《中国微生态学杂志》。
《大连医科大学学报》创刊于1960年，是由辽宁省教育厅主管，大连医科大学主办的学术期刊。杂志集中报道医学科研新进展和新成果，探讨目前医学新技术和新方法，为医学高校师生及临床医生进行医学研究提供参考和拓宽思路。杂志目前为双月刊，主要刊登专家述评、基础医学、临床医学、综述、病例报告、医学教育等方面的文章。
《医学与哲学》杂志创刊于1980年，是由中国科学技术协会主管、中国自然辩证法研究会主办的国家级学术期刊。《医学与哲学》杂志是一本大型医学人文与医学评论刊物，本着“开阔视野、启迪思维、提供方法、促进发展”和“关注热点，挑战现实，放眼世界”的办刊宗旨，引领广大学者探寻：当代医学发展的新理念、新思想、新动向；临床思维与最佳诊疗决策的评估；医学伦理学理论及其在医疗保健服务中的践行；医学人文如何深入临床、科研、预防与公共卫生；我国医疗卫生体制改革的哲学审视等。现被收录入“中国科技核心期刊”（中国科技论文统计源期刊）、中国人文社会科学引文数据库来源期刊。
《中国微生态学杂志》创刊于1989年，月刊，是由国家卫生健康委员会主管，中华预防医学会和大连医科大学主办的中华预防医学会系列杂志之一。杂志积极贯彻预防为主的卫生工作方针，坚持理论与实践、科研与开发相结合；加强医学、兽医学、生物学的微生态学学术交流促进学科发展；介绍微生态学科研成果与防治经验，为保障人民健康，发展农业及牧畜业生产提供科学咨询。主要栏目：口腔微生态学、妇科微生态学、论著、临床研究、综述、技术与方法、流行病学、学术争鸣、调查研究等。读者群体：微生态学专业以及与该专业有关的各类专业人员。
杂志社诸本杂志的成长和发展，是与广大读者与作者的长期关爱、支持与呵护分不开的，杂志社的全体员工祈望得到更多更持久的这种支持，也欢迎大家踊跃投稿。
